Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARA5Q6ZMJ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms