Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UFSP1Q6NVU6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms