Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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TMEM200BQ69YZ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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TMEM200BQ69YZ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200BQ69YZ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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