Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ECM29Q5VYK3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM29Q5VYK3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms