Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00242Q5T6M2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms