Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP188Q5SRE5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP188Q5SRE5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP188Q5SRE5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms