Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF2Q5BJF6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms