Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC178Q5BJE1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC178Q5BJE1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC178Q5BJE1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms