Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSP90AB4PQ58FF6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB4PQ58FF6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB4PQ58FF6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms