Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALFQ53S48 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ALFQ53S48 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms