Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT71Q3SY84 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT71Q3SY84 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms