Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TXNRD1Q16881 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TXNRD1Q16881 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
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