Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP3Q15836 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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