Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85BQ15834 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85BQ15834 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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