Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD6Q15008 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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