Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHD4Q14839 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
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CHD4Q14839 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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CHD4Q14839 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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CHD4Q14839 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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CHD4Q14839 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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CHD4Q14839 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
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CHD4Q14839 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHD4Q14839 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
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