Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDC1Q14676 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDC1Q14676 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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