Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCIRG1Q13488 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TCIRG1Q13488 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TCIRG1Q13488 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCIRG1Q13488 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCIRG1Q13488 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCIRG1Q13488 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCIRG1Q13488 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TCIRG1Q13488 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TCIRG1Q13488 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TCIRG1Q13488 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCIRG1Q13488 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
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