Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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