Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 CSR1YLR380W 1227 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 YLR407WYLR407W 687 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 ATG22YCL038C 1587 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 FLO8YER109C 2400 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 EFT2YDR385W 2529 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 EFT1YOR133W 2529 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 YEL067CYEL067C 588 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 FLD1YLR404W 858 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 RAD28YDR030C 1521 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 VAN1YML115C 1608 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 CAB3YKL088W 1716 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 PDR10YOR328W 4695 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 PWP1YLR196W 1731 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 YIL001WYIL001W 1542 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 RFA2YNL312W 822 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 SWC3YAL011W 1878 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 ACS1YAL054C 2142 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 IMD2YHR216W 1572 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 FAR10YLR238W 1437 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 RML2YEL050C 1182 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 BAT2YJR148W 1131 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 RPL18BYNL301C 561 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 HES1YOR237W 1305 nt6.52□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 YHR182WYHR182W 2358 nt6.52□□□□□ -1.36
TY1B-GR3Q12316 ATF1YOR377W 1578 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 MAL11YGR289C 1851 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 GTT2YLL060C 702 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 VPS68YOL129W 555 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 HIS4YCL030C 2400 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 NUP42YDR192C 1293 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 YGL214WYGL214W 486 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 CDC28YBR160W 897 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 IMP1YMR150C 573 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 UBX2YML013W 1755 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 RAD16YBR114W 2373 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 RMD9YGL107C 1941 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 YTA12YMR089C 2478 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 YDR193WYDR193W 399 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 SGN1YIR001C 753 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 ILV5YLR355C 1188 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 YBR219CYBR219C 384 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 POP1YNL221C 2628 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 VAS1YGR094W 3315 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 AAD4YDL243C 990 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 YDR090CYDR090C 933 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 RPL28YGL103W 450 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 LOH1YJL038C 660 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 HXT2YMR011W 1626 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 CEX1YOR112W 2286 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 SLX1YBR228W 915 nt6.46□□□□□ -1.37
TY1B-GR3Q12316 MSW1YDR268W 1140 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 SDS3YIL084C 984 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YIL152WYIL152W 708 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 PGM2YMR105C 1710 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 FBP1YLR377C 1047 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 VTC2YFL004W 2487 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 MTH1YDR277C 1302 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YLR446WYLR446W 1302 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 NMD5YJR132W 3147 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 HSP30YCR021C 999 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YJR038CYJR038C 363 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 ABZ1YNR033W 2364 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 CCZ1YBR131W 2115 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YGL072CYGL072C 360 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YML031C-AYML031C-A 336 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 EOS1YNL080C 1101 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YBR053CYBR053C 1077 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 ZRT1YGL255W 1131 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 MGS1YNL218W 1764 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 MET17YLR303W 1335 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 PDR18YNR070W 4002 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 MCM5YLR274W 2328 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 TAF5YBR198C 2397 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 SLA1YBL007C 3735 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YDC1YPL087W 954 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 CYC8YBR112C 2901 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 RAD4YER162C 2265 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 CYM1YDR430C 2970 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YER190C-BYER190C-B 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YFL068WYFL068W 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 NAT2YGR147C 867 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-GR3Q12316 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt6.4□□□□□ -1.38
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