Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 RPR2YIR015W 435 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YJR071WYJR071W 369 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 HMS2YJR147W 1077 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YBR300CYBR300C 498 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 KIN28YDL108W 921 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 NPY1YGL067W 1155 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 HRA1HRA1 564 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 LDS1YAL018C 978 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YJR141WYJR141W 1044 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 BOS1YLR078C 735 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 ICT1YLR099C 1185 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 CPT1YNL130C 1182 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 HST2YPL015C 1074 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YAH1YPL252C 519 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YBR226CYBR226C 411 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 COQ6YGR255C 1440 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 ADE13YLR359W 1449 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 EDC2YER035W 438 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 PRY2YKR013W 990 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 GSP1YLR293C 660 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 SAM37YMR060C 984 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 SNO4YMR322C 714 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YBR012CYBR012C 420 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 HSP33YOR391C 714 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 UIP4YPL186C 915 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 HSP32YPL280W 714 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YPR197CYPR197C 564 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 MUP3YHL036W 1641 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 GPI11YDR302W 660 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YGL260WYGL260W 231 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YGL262WYGL262W 528 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 RTA1YGR213C 954 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YNK1YKL067W 462 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 MTD1YKR080W 963 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YMR082CYMR082C 357 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 snR11snR11 258 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 MCA1YOR197W 1299 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 MKS1YNL076W 1755 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 FCY2YER056C 1602 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 SPS1YDR523C 1473 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YBL111CYBL111C 2004 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 PRR2YDL214C 2100 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 NUP42YDR192C 1293 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 RPL22BYFL034C-A 369 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 NCA3YJL116C 1014 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 SPC3YLR066W 555 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 RPS31YLR167W 459 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 RPS1AYLR441C 768 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 BBP1YPL255W 1158 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 NTA1YJR062C 1374 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 BDS1YOL164W 1941 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 TOS1YBR162C 1368 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 SLT2YHR030C 1455 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 KTR6YPL053C 1341 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 BAP3YDR046C 1815 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 MSB3YNL293W 1902 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YDR203WYDR203W 318 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YDR327WYDR327W 327 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 ERD1YDR414C 1089 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 RNR2YJL026W 1200 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 MCM22YJR135C 720 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YKL147CYKL147C 618 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 JLP1YLL057C 1239 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 LOT6YLR011W 576 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 RPC19YNL113W 429 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 FYV12YOR183W 390 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 YOR300WYOR300W 309 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 ERV2YPR037C 591 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 ASR1YPR093C 867 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 PPZ2YDR436W 2133 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 FKH1YIL131C 1455 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1A-BLQ12266 SET4YJL105W 1683 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 PUT1YLR142W 1431 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 PSA1YDL055C 1086 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 HLR1YDR528W 1272 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 PRS2YER099C 957 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 SEH1YGL100W 1050 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 YJL193WYJL193W 1209 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 YPL185WYPL185W 396 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 GDI1YER136W 1356 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 LTV1YKL143W 1392 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 ERG8YMR220W 1356 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 SLM5YCR024C 1479 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 GDA1YEL042W 1557 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 CDC3YLR314C 1563 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 TFG1YGR186W 2208 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 RPT2YDL007W 1314 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1A-BLQ12266 PHO3YBR092C 1404 nt6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms