Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 AAD4YDL243C 990 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 AIM26YKL037W 357 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 PER33YLR064W 822 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 FLO8YER109C 2400 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 POP1YNL221C 2628 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 RNR3YIL066C 2610 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 ABZ1YNR033W 2364 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 MSK1YNL073W 1731 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 YML116W-AYML116W-A 303 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 YIL001WYIL001W 1542 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 YHR182WYHR182W 2358 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 KIN4YOR233W 2403 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 RPL28YGL103W 450 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 RSF1YMR030W 1131 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 AIP1YMR092C 1848 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 MBR1YKL093W 1020 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 HMX1YLR205C 954 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-LR1Q12088 TDA1YMR291W 1761 nt6.4□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 SEC39YLR440C 2130 nt6.4□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 YHR173CYHR173C 339 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 HIS4YCL030C 2400 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 AGA1YNR044W 2178 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 RET3YPL010W 570 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 YTA12YMR089C 2478 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 PDR18YNR070W 4002 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 VPS68YOL129W 555 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 NRD1YNL251C 1728 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 MGS1YNL218W 1764 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 CYC8YBR112C 2901 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 FLD1YLR404W 858 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 NMD5YJR132W 3147 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 LOH1YJL038C 660 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 RPL18BYNL301C 561 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 UBX2YML013W 1755 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 FBP1YLR377C 1047 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1B-LR1Q12088 YGL072CYGL072C 360 nt6.34□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt6.34□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 TIF34YMR146C 1044 nt6.34□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 RFA2YNL312W 822 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 TAF5YBR198C 2397 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 STE7YDL159W 1548 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YER190C-BYER190C-B 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YFL068WYFL068W 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 NAT2YGR147C 867 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 BAT2YJR148W 1131 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YML133W-BYML133W-B 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 SLX1YBR228W 915 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 CYM1YDR430C 2970 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 MNN2YBR015C 1794 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 DAN1YJR150C 897 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YKL023WYKL023W 834 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 ATF1YOR377W 1578 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 BZZ1YHR114W 1902 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 RAD16YBR114W 2373 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 MCM5YLR274W 2328 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 VID27YNL212W 2349 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 SGN1YIR001C 753 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 GTT2YLL060C 702 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YML031C-AYML031C-A 336 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YBR219CYBR219C 384 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 IMP1YMR150C 573 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1B-LR1Q12088 YJR038CYJR038C 363 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 HSP30YCR021C 999 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 MSW1YDR268W 1140 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 AUA1YFL010W-A 285 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 EOS1YNL080C 1101 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 VPS69YPR087W 321 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 YER158CYER158C 1722 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 MET17YLR303W 1335 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 SLA1YBL007C 3735 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 NUP42YDR192C 1293 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 HEK2YBL032W 1146 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 HXK2YGL253W 1461 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1B-LR1Q12088 RDN5-1RDN5-1 121 nt6.23□□□□□ -1.41
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