Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	PRT1	YOR361C	2292 nt		4.66	□□□□□ -1.66
VIK1	Q12045	CTT1	YGR088W	1689 nt		4.65	□□□□□ -1.66
VIK1	Q12045	YMR102C	YMR102C	2505 nt		4.65	□□□□□ -1.66
VIK1	Q12045	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	RDL1	YOR285W	420 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	FAP1	YNL023C	2898 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	MKS1	YNL076W	1755 nt		4.65	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	TIM54	YJL054W	1437 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	MMT2	YPL224C	1455 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	NSG1	YHR133C	876 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	ORC6	YHR118C	1308 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	ALD3	YMR169C	1521 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	ALD2	YMR170C	1521 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	PEX7	YDR142C	1128 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	SLO1	YER180C-A	258 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	COS6	YGR295C	1146 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	ERP5	YHR110W	639 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	EFM4	YIL064W	774 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YLR118C	YLR118C	684 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	GPI12	YMR281W	915 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YNL067W-A	YNL067W-A	147 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	TRM10	YOL093W	882 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	GSP2	YOR185C	663 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	LYS2	YBR115C	4179 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	THI21	YPL258C	1656 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	NNK1	YKL171W	2787 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	CDC10	YCR002C	969 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YGR035W-A	YGR035W-A	222 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	EGD2	YHR193C	525 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YKL151C	YKL151C	1014 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YNL194C	YNL194C	906 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	CBP3	YPL215W	1008 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	KIC1	YHR102W	3243 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	UGA2	YBR006W	1494 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	PRM7	YDL039C	2097 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	RIP1	YEL024W	648 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YHR095W	YHR095W	495 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YHR140W	YHR140W	720 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	NHP6A	YPR052C	282 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	POP4	YBR257W	840 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	SBE2	YDR351W	2595 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	HXT4	YHR092C	1731 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	ADY2	YCR010C	852 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	KRE9	YJL174W	831 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	SPS18	YNL204C	903 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	STB2	YMR053C	2553 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	FPK1	YNR047W	2682 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	MDM34	YGL219C	1380 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	TDA11	YHR159W	1515 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	GSM1	YJL103C	1857 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	CDC48	YDL126C	2508 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	GET3	YDL100C	1065 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	RVB1	YDR190C	1392 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	PDR15	YDR406W	4590 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	ARC1	YGL105W	1131 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	SKG6	YHR149C	2205 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YLR194C	YLR194C	765 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	YML119W	YML119W	1074 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	TOM7	YNL070W	183 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	SNN1	YNL086W	309 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	PRD1	YCL057W	2139 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VIK1	Q12045	PMT5	YDL093W	2232 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YHR177W	YHR177W	1362 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YOR318C	YOR318C	306 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	PEP5	YMR231W	3090 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	JEM1	YJL073W	1938 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YBR139W	YBR139W	1527 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	HNT2	YDR305C	654 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	PRO3	YER023W	861 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YNL174W	YNL174W	573 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	BUD17	YNR027W	954 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	PDX3	YBR035C	687 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	HUL4	YJR036C	2679 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	CDS1	YBR029C	1374 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	PRP40	YKL012W	1752 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	MDM30	YLR368W	1797 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YER158C	YER158C	1722 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	AIR2	YDL175C	1035 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	GSY1	YFR015C	2127 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	PFK1	YGR240C	2964 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YJL218W	YJL218W	591 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	TDA5	YLR426W	981 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	MDG1	YNL173C	1101 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	EAR1	YMR171C	1653 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	TAF5	YBR198C	2397 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	GUS1	YGL245W	2127 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	TRE1	YPL176C	2352 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	MTF2	YDL044C	1323 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	NVJ1	YHR195W	966 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YLR125W	YLR125W	411 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YNL228W	YNL228W	777 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	SCP1	YOR367W	603 nt		4.55	□□□□□ -1.68

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