Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CPSF1Q10570 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
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