Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 SEC39YLR440C 2130 nt5.24□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 IMA1YGR287C 1770 nt5.24□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 WHI4YDL224C 1950 nt5.24□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 DRS1YLL008W 2259 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 VPS72YDR485C 2388 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 TDA6YPR157W 1404 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 RPL12AYEL054C 498 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 YJR012CYJR012C 624 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 ADD66YKL206C 804 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 YCL012CYCL012C 405 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 FAA4YMR246W 2085 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 APM2YHL019C 1818 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 YEH2YLR020C 1617 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 STE7YDL159W 1548 nt5.23□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 CLB4YLR210W 1383 nt5.22□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 YET2YMR040W 483 nt5.22□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 TIF34YMR146C 1044 nt5.22□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 POS5YPL188W 1245 nt5.22□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 UMP1YBR173C 447 nt5.22□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 TUB3YML124C 1338 nt5.22□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 RIM15YFL033C 5313 nt5.21□□□□□ -1.57
DSE3Q08729 SYP1YCR030C 2613 nt5.21□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 RVB1YDR190C 1392 nt5.21□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YMR111CYMR111C 1389 nt5.21□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 ARF2YDL137W 546 nt5.21□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 GSP2YOR185C 663 nt5.21□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 PXA1YPL147W 2613 nt5.21□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 UBA2YDR390C 1911 nt5.21□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 CBF5YLR175W 1452 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 CNM67YNL225C 1746 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 EXO1YOR033C 2109 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 SNF3YDL194W 2655 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 TYW3YGL050W 822 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 SUT1YGL162W 900 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YJL193WYJL193W 1209 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YKL023WYKL023W 834 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 ECM23YPL021W 564 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 MAK3YPR051W 531 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 SAS4YDR181C 1446 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 ERG4YGL012W 1422 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 GAS3YMR215W 1575 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 RPN5YDL147W 1338 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YMD8YML038C 1329 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 RTC5YOR118W 1704 nt5.2□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 HOF1YMR032W 2010 nt5.19□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 FRS1YLR060W 1788 nt5.19□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 ALD3YMR169C 1521 nt5.19□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 ALD2YMR170C 1521 nt5.19□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 PCT1YGR202C 1275 nt5.19□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 CIN5YOR028C 888 nt5.19□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YPR109WYPR109W 885 nt5.19□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 ARR1YPR199C 885 nt5.19□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 RKM4YDR257C 1485 nt5.19□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 SDA1YGR245C 2304 nt5.18□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YDL012CYDL012C 324 nt5.18□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YDL121CYDL121C 450 nt5.18□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YGR066CYGR066C 879 nt5.18□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 CDC28YBR160W 897 nt5.18□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 PSE1YMR308C 3270 nt5.17□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 TUP1YCR084C 2142 nt5.17□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 SPR6YER115C 576 nt5.17□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.17□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 JJJ3YJR097W 519 nt5.17□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 SSB2YNL209W 1842 nt5.17□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 KGD1YIL125W 3045 nt5.17□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YER187WYER187W 426 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 CIA2YHR122W 696 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 DCD1YHR144C 939 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 SPO12YHR152W 522 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YLR036CYLR036C 612 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YLR311CYLR311C 348 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 PCL1YNL289W 840 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 RGS2YOR107W 930 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 PEP4YPL154C 1218 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 NOP58YOR310C 1536 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 EMP46YLR080W 1335 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 MPC54YOR177C 1395 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 YPL245WYPL245W 1365 nt5.16□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 ALG6YOR002W 1635 nt5.15□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 DBF2YGR092W 1719 nt5.15□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 OCA5YHL029C 2040 nt5.15□□□□□ -1.58
DSE3Q08729 snR57snR57 88 nt5.15□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 RPS16BYDL083C 432 nt5.15□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 YDR509WYDR509W 348 nt5.15□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 ACP1YKL192C 378 nt5.15□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 SED5YLR026C 1023 nt5.15□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 NMD4YLR363C 657 nt5.15□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 MAP2YBL091C 1266 nt5.15□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 SKG3YLR187W 3081 nt5.15□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 MPP10YJR002W 1782 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 UBX2YML013W 1755 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 RCK2YLR248W 1833 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 SAP4YGL229C 2457 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 PEX19YDL065C 1029 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 YLR346CYLR346C 306 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 YGP1YNL160W 1065 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 HEM15YOR176W 1182 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 UBA1YKL210W 3075 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 HER2YMR293C 1395 nt5.14□□□□□ -1.59
DSE3Q08729 ATH1YPR026W 3636 nt5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms