Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms