Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF9Q07011 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms