Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF11Q05519 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF11Q05519 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms