Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TAP1Q03518 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms