Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms