Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1DQ01668 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms