Protein–RNA interactions for Protein: Q01081

U2AF1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1Q01081 ELP2-202ENST00000351393 2453 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.013e-7■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 ELP2-210ENST00000539560 2542 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.333e-7■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 ELP2-205ENST00000442325 2722 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.443e-7■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.543e-7■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 TBCK-218ENST00000511011 560 ntTSL 414.55□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 TBCK-220ENST00000515705 592 ntTSL 512.36□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 TBCK-219ENST00000514689 703 ntTSL 37.02□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 TBCK-212ENST00000506615 593 ntTSL 36.82□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 TBCK-217ENST00000510927 2826 ntTSL 26.12□□□□□ -1.432e-6■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.351e-8■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.111e-8■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 01e-8■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 USP14-205ENST00000578942 3189 ntTSL 213.98□□□□□ -0.171e-8■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-8■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 USP14-209ENST00000583119 578 ntTSL 54.09□□□□□ -1.751e-8■■■■□ 21.4
U2AF1Q01081 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.343e-10■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-208ENST00000527298 1569 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.456e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.266e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-216ENST00000530514 2092 ntTSL 211.53□□□□□ -0.566e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.76e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-224ENST00000534814 512 ntTSL 59.54□□□□□ -0.886e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-211ENST00000527964 554 ntTSL 49.54□□□□□ -0.886e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-203ENST00000525021 735 ntTSL 59.43□□□□□ -0.96e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-219ENST00000533538 1281 ntTSL 29.43□□□□□ -0.96e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-225ENST00000602788 4698 ntTSL 58.77□□□□□ -16e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-204ENST00000525037 1406 ntTSL 55.97□□□□□ -1.456e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 NPEPPS-209ENST00000527360 534 ntTSL 54.59□□□□□ -1.676e-12■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.994e-6■■■■□ 21.3
U2AF1Q01081 HPS4-214ENST00000485842 973 ntTSL 315.85■□□□□ 0.136e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-202ENST00000398145 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.176e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-204ENST00000422379 1942 ntTSL 511.95□□□□□ -0.56e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-203ENST00000402105 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.546e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-208ENST00000464362 4277 ntTSL 511.69□□□□□ -0.546e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-209ENST00000466781 6136 ntTSL 1 (best)10.91□□□□□ -0.666e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-217ENST00000496385 2772 ntTSL 210.72□□□□□ -0.696e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.76e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-206ENST00000439453 3936 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.726e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-207ENST00000459918 556 ntTSL 510.51□□□□□ -0.736e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 HPS4-205ENST00000429411 3492 ntTSL 210.37□□□□□ -0.756e-11■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 PSMB4-206ENST00000495288 986 ntTSL 223.33■■□□□ 1.337e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 PSMB4-205ENST00000493673 1650 ntTSL 521.24■□□□□ 0.997e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 PSMB4-207ENST00000495805 811 ntTSL 218.04■□□□□ 0.487e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.437e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 217.6■□□□□ 0.417e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 59.66□□□□□ -0.867e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 PSMB4-202ENST00000466425 665 ntTSL 28.53□□□□□ -1.047e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.621e-6■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBC1D23-209ENST00000496167 568 ntTSL 514.45□□□□□ -0.13e-9■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBC1D23-208ENST00000486274 4054 ntTSL 513.96□□□□□ -0.183e-9■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.943e-9■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.083e-9■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.353e-9■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBL1XR1-226ENST00000636348 100 ntTSL 55.12□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBL1XR1-233ENST00000637659 3105 ntTSL 55.02□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBL1XR1-222ENST00000631253 4186 ntTSL 52.75□□□□□ -1.972e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBL1XR1-228ENST00000636864 6888 ntTSL 52.6□□□□□ -1.991e-6■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.012e-7■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 TBL1XR1-218ENST00000626758 355 ntTSL 51.62□□□□□ -2.151e-6■■■■□ 21.2
U2AF1Q01081 WDR73-208ENST00000559126 2031 ntTSL 225.62■■□□□ 1.699e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-210ENST00000559224 788 ntTSL 522.77■■□□□ 1.249e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-205ENST00000558521 997 ntTSL 322.77■■□□□ 1.249e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-211ENST00000559452 1240 ntTSL 320.86■□□□□ 0.939e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-213ENST00000559994 2063 ntTSL 520.37■□□□□ 0.859e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-207ENST00000559015 2140 ntTSL 220.18■□□□□ 0.829e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-206ENST00000558608 2154 ntTSL 219.14■□□□□ 0.659e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-201ENST00000398528 1915 ntTSL 1 (best)18.44■□□□□ 0.549e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-218ENST00000560966 5071 ntTSL 216.69■□□□□ 0.269e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.139e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-219ENST00000561329 1007 ntTSL 214.51□□□□□ -0.099e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 AKR1C1-204ENST00000476100 713 ntTSL 214.43□□□□□ -0.19e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-217ENST00000560835 582 ntTSL 212.85□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-209ENST00000559178 933 ntTSL 312.81□□□□□ -0.369e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-214ENST00000560088 526 ntTSL 311.8□□□□□ -0.529e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 WDR73-221ENST00000561447 560 ntTSL 411.51□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ANKRD17-206ENST00000514252 3259 ntTSL 26.1□□□□□ -1.439e-7■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 527.42■■□□□ 1.981e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 PRSS53-203ENST00000492427 1782 ntTSL 325.49■■□□□ 1.671e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.362e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 223.06■■□□□ 1.281e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-205ENST00000504359 565 ntTSL 421.79■■□□□ 1.082e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-211ENST00000479504 559 ntTSL 421.42■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-203ENST00000465058 534 ntTSL 421.42■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 221.36■■□□□ 1.011e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.882e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-204ENST00000466809 588 ntTSL 520.45■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-214ENST00000492771 564 ntTSL 416.96■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-220ENST00000515326 1050 ntTSL 1 (best)15.84■□□□□ 0.132e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-212ENST00000509156 2063 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-216ENST00000510026 2599 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-213ENST00000509341 572 ntTSL 514□□□□□ -0.172e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 512.01□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZFR-205ENST00000507465 1140 ntTSL 511.43□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-207ENST00000507218 1352 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.682e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-208ENST00000469723 556 ntTSL 510.75□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 GABRE-204ENST00000462018 650 ntTSL 310.37□□□□□ -0.753e-10■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-209ENST00000507393 583 ntTSL 410.29□□□□□ -0.762e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-9■■■■□ 21.1
U2AF1Q01081 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.021e-6■■■■□ 21.1
Retrieved 100 of 10,096 protein–RNA pairs in 50 ms