Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms