Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFRD-1P60508 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms