Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLTPP55058 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLTPP55058 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLTPP55058 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLTPP55058 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLTPP55058 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLTPP55058 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLTPP55058 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLTPP55058 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLTPP55058 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLTPP55058 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLTPP55058 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLTPP55058 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLTPP55058 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLTPP55058 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLTPP55058 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLTPP55058 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLTPP55058 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLTPP55058 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLTPP55058 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLTPP55058 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLTPP55058 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLTPP55058 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLTPP55058 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLTPP55058 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLTPP55058 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLTPP55058 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLTPP55058 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLTPP55058 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLTPP55058 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLTPP55058 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLTPP55058 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLTPP55058 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLTPP55058 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLTPP55058 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLTPP55058 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLTPP55058 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLTPP55058 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLTPP55058 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLTPP55058 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLTPP55058 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLTPP55058 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLTPP55058 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLTPP55058 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLTPP55058 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLTPP55058 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms