Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms