Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VEGFBP49765 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms