Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms