Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSNK1DP48730 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSNK1DP48730 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms