Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPTX2P47972 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms