Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDH1P40925 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDH1P40925 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDH1P40925 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDH1P40925 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH1P40925 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDH1P40925 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDH1P40925 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDH1P40925 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH1P40925 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH1P40925 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH1P40925 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH1P40925 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH1P40925 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH1P40925 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH1P40925 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDH1P40925 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDH1P40925 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDH1P40925 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MDH1P40925 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDH1P40925 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDH1P40925 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH1P40925 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH1P40925 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH1P40925 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDH1P40925 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDH1P40925 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDH1P40925 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDH1P40925 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MDH1P40925 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms