Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH1P40692 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH1P40692 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH1P40692 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH1P40692 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH1P40692 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH1P40692 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH1P40692 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH1P40692 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH1P40692 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH1P40692 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH1P40692 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH1P40692 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH1P40692 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH1P40692 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH1P40692 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH1P40692 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH1P40692 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH1P40692 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH1P40692 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH1P40692 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH1P40692 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH1P40692 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH1P40692 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH1P40692 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH1P40692 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH1P40692 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH1P40692 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH1P40692 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH1P40692 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH1P40692 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH1P40692 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH1P40692 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH1P40692 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH1P40692 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH1P40692 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH1P40692 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH1P40692 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH1P40692 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH1P40692 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH1P40692 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH1P40692 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH1P40692 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms