Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEACAM3P40198 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms