Protein–RNA interactions for Protein: P38708

YHR020W, Putative proline--tRNA ligase YHR020W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR020WP38708 MRPS16YPL013C 366 nt5.93□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 SLM5YCR024C 1479 nt5.93□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 SUM1YDR310C 3189 nt5.93□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 RGP1YDR137W 1992 nt5.93□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 CST6YIL036W 1764 nt5.93□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 VAN1YML115C 1608 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 GAS5YOL030W 1455 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 PEX19YDL065C 1029 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YDR278CYDR278C 318 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 GIC2YDR309C 1152 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YEL068CYEL068C 333 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YGL218WYGL218W 651 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 DCD1YHR144C 939 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 BCY1YIL033C 1251 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 RHO3YIL118W 696 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 SYN8YAL014C 768 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 MER1YNL210W 813 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 GLO4YOR040W 858 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 IFA38YBR159W 1044 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 ROG3YFR022W 2202 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 GAS3YMR215W 1575 nt5.92□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 SKS1YPL026C 1509 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 ABZ1YNR033W 2364 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 HIM1YDR317W 1245 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YGL199CYGL199C 471 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 SUI2YJR007W 915 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YLR118CYLR118C 684 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 CKB2YOR039W 777 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 ENV9YOR246C 993 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 TGS1YPL157W 948 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 LYS21YDL131W 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 HST3YOR025W 1344 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 ERG4YGL012W 1422 nt5.91□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 PCL8YPL219W 1479 nt5.9□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 RNH202YDR279W 1053 nt5.9□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 PAD1YDR538W 729 nt5.9□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YER010CYER010C 705 nt5.9□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt5.9□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YAL064WYAL064W 285 nt5.9□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 URA4YLR420W 1095 nt5.9□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YMR084WYMR084W 789 nt5.9□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 YOR342CYOR342C 960 nt5.9□□□□□ -1.46
YHR020WP38708 ECM3YOR092W 1842 nt5.9□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 NPA3YJR072C 1158 nt5.89□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YPR114WYPR114W 948 nt5.89□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YDL186WYDL186W 834 nt5.88□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 ACT1YFL039C 1128 nt5.88□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YLR365WYLR365W 333 nt5.88□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 POP8YBL018C 402 nt5.88□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 HAP3YBL021C 435 nt5.88□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.88□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 snR189snR189 189 nt5.88□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YBR219CYBR219C 384 nt5.88□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 FBP26YJL155C 1359 nt5.88□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 MSS2YDL107W 1056 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 RPT3YDR394W 1287 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YHB1YGR234W 1200 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 CIN4YMR138W 576 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 ROT1YMR200W 771 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YOL107WYOL107W 1029 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 ENV7YPL236C 1095 nt5.87□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 TNA1YGR260W 1605 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 DPH2YKL191W 1605 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 TEP1YNL128W 1305 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 CWC21YDR482C 408 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YLR296WYLR296W 327 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 CDC73YLR418C 1182 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YNL217WYNL217W 981 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 PDR16YNL231C 1056 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 CPR8YNR028W 927 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 SCO1YBR037C 888 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 TAZ1YPR140W 1146 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 OXP1YKL215C 3861 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 KKQ8YKL168C 2175 nt5.86□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 STB3YDR169C 1542 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 TRM13YOL125W 1431 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 TYR1YBR166C 1359 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 SIT4YDL047W 936 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YHR054CYHR054C 1065 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 ECM19YLR390W 339 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 AIM39YOL053W 1188 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YOL118CYOL118C 309 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 PDX3YBR035C 687 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 ECM8YBR076W 1065 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 MDL1YLR188W 2088 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 MOT2YER068W 1764 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 GGA1YDR358W 1674 nt5.85□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 TSL1YML100W 3297 nt5.84□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 RAD24YER173W 1980 nt5.84□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 ADE12YNL220W 1302 nt5.84□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 OCT1YKL134C 2319 nt5.84□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 PHB1YGR132C 864 nt5.84□□□□□ -1.47
YHR020WP38708 YNL303WYNL303W 348 nt5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms