Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVRL1P37023 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms