Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYH11P35749 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYH11P35749 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYH11P35749 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH11P35749 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH11P35749 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH11P35749 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH11P35749 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH11P35749 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH11P35749 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH11P35749 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH11P35749 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH11P35749 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH11P35749 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH11P35749 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH11P35749 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH11P35749 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH11P35749 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH11P35749 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH11P35749 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH11P35749 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH11P35749 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH11P35749 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH11P35749 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH11P35749 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYH11P35749 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYH11P35749 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYH11P35749 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYH11P35749 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYH11P35749 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYH11P35749 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYH11P35749 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYH11P35749 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYH11P35749 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYH11P35749 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYH11P35749 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYH11P35749 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYH11P35749 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYH11P35749 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYH11P35749 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYH11P35749 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYH11P35749 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYH11P35749 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYH11P35749 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYH11P35749 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYH11P35749 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYH11P35749 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYH11P35749 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYH11P35749 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYH11P35749 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYH11P35749 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYH11P35749 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYH11P35749 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYH11P35749 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYH11P35749 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYH11P35749 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYH11P35749 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms