Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIMP3P35625 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMP3P35625 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms