Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms