Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCP1P17987 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCP1P17987 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCP1P17987 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCP1P17987 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCP1P17987 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCP1P17987 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCP1P17987 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCP1P17987 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCP1P17987 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCP1P17987 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCP1P17987 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCP1P17987 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCP1P17987 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCP1P17987 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCP1P17987 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCP1P17987 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCP1P17987 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCP1P17987 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCP1P17987 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCP1P17987 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCP1P17987 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCP1P17987 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCP1P17987 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCP1P17987 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCP1P17987 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCP1P17987 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCP1P17987 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCP1P17987 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCP1P17987 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCP1P17987 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCP1P17987 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCP1P17987 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TCP1P17987 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TCP1P17987 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCP1P17987 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCP1P17987 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCP1P17987 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCP1P17987 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCP1P17987 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCP1P17987 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCP1P17987 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCP1P17987 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCP1P17987 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCP1P17987 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCP1P17987 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCP1P17987 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCP1P17987 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCP1P17987 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCP1P17987 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCP1P17987 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCP1P17987 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms