Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-EP13747 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms